More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0706 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
493 aa  926    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
485 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  39.83 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  39.19 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  38.97 
 
 
485 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
485 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.78 
 
 
485 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  38.97 
 
 
487 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  38.97 
 
 
487 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
485 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
485 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
485 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
485 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  39.57 
 
 
485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  38.76 
 
 
487 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  40.67 
 
 
485 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  40.64 
 
 
485 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.68 
 
 
479 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  39.16 
 
 
487 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.58 
 
 
476 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  41.06 
 
 
425 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  41.06 
 
 
425 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  39.19 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  38.76 
 
 
489 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  39.25 
 
 
493 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  40.87 
 
 
489 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  40.87 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  41.05 
 
 
487 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  38.56 
 
 
489 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  38.36 
 
 
486 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.6 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  40.09 
 
 
490 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.14 
 
 
489 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  42.62 
 
 
486 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  32.52 
 
 
492 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  38.31 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.85 
 
 
484 aa  233  9e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.52 
 
 
492 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.05 
 
 
476 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.7 
 
 
507 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.87 
 
 
481 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.38 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.56 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.61 
 
 
478 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.96 
 
 
505 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.57 
 
 
478 aa  210  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.82 
 
 
491 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  37.13 
 
 
479 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.82 
 
 
491 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  33.26 
 
 
484 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.82 
 
 
491 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  36.63 
 
 
478 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.27 
 
 
477 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.52 
 
 
517 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.95 
 
 
487 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 
478 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  34.04 
 
 
485 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.28 
 
 
517 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  33.83 
 
 
485 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.82 
 
 
484 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.21 
 
 
497 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.77 
 
 
484 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.8 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  34.66 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.01 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.01 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  33.09 
 
 
478 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.59 
 
 
482 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  36.86 
 
 
531 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5466  NADH dehydrogenase subunit N  35 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.59 
 
 
479 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  36.78 
 
 
475 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5415  NADH dehydrogenase subunit N  35.06 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1636  NADH dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5381  NADH dehydrogenase subunit N  34.3 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000455286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5140  NADH dehydrogenase subunit N  34.1 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5532  NADH dehydrogenase subunit N  34.1 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.89 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  34.1 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0641  NADH dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4972  NADH dehydrogenase subunit N  34.3 
 
 
506 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 
492 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3180  NADH dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
463 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.48 
 
 
514 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.47 
 
 
487 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.2 
 
 
482 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.24 
 
 
489 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.03 
 
 
473 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.33 
 
 
483 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  34.71 
 
 
487 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.36 
 
 
476 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.42 
 
 
492 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.26 
 
 
521 aa  193  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  36 
 
 
479 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2153  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.3 
 
 
520 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.547893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>