More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0596 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  100 
 
 
492 aa  978    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  70.73 
 
 
491 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  97.56 
 
 
492 aa  962    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  48.57 
 
 
487 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  49.69 
 
 
486 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.26 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  43.58 
 
 
485 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  49.38 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  47.85 
 
 
489 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  48.06 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  48.39 
 
 
489 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  48.79 
 
 
489 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  43.53 
 
 
485 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  43.93 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  43.93 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  43.66 
 
 
487 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  43.66 
 
 
487 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  43.93 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  43.66 
 
 
487 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  43.93 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  44.28 
 
 
485 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  43.93 
 
 
485 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  47.65 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  43.53 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  49.39 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  47.65 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.06 
 
 
485 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  43.06 
 
 
485 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  43.06 
 
 
485 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  43 
 
 
485 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  43.06 
 
 
485 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  43.06 
 
 
485 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  43.06 
 
 
485 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  48.45 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  43.72 
 
 
485 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  47.76 
 
 
490 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  44.2 
 
 
425 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  44.2 
 
 
425 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.08 
 
 
484 aa  320  3e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.82 
 
 
479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  41.08 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.57 
 
 
481 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.73 
 
 
507 aa  266  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.38 
 
 
486 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.31 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.05 
 
 
476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.22 
 
 
484 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.93 
 
 
487 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.78 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.36 
 
 
484 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.65 
 
 
476 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.43 
 
 
484 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  35.2 
 
 
476 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  38.3 
 
 
479 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  31.85 
 
 
482 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  36.97 
 
 
480 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  31.66 
 
 
482 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.68 
 
 
492 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  35.35 
 
 
489 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  35.92 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  35.92 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.81 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.5 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  34.12 
 
 
488 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.31 
 
 
483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  34.12 
 
 
488 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  34.05 
 
 
488 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  34.05 
 
 
488 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  34.05 
 
 
488 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  32.72 
 
 
485 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  32.93 
 
 
485 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  34.05 
 
 
489 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.62 
 
 
491 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.03 
 
 
477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.93 
 
 
482 aa  217  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  33.1 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.81 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.74 
 
 
473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.78 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  35.06 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  36.91 
 
 
481 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.54 
 
 
517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  33.61 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.88 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  36.46 
 
 
478 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  33.88 
 
 
491 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  36.64 
 
 
481 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  32.31 
 
 
493 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  31.31 
 
 
478 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>