More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3813 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
479 aa  944    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  42.95 
 
 
485 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  42.74 
 
 
485 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  42.74 
 
 
485 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  46.11 
 
 
486 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  42.74 
 
 
485 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  42.74 
 
 
485 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  46.11 
 
 
486 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 
485 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  41.88 
 
 
485 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.37 
 
 
481 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  41.88 
 
 
485 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  41.91 
 
 
487 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  42.09 
 
 
485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  46.77 
 
 
490 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  41.68 
 
 
487 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  41.68 
 
 
487 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  44.44 
 
 
487 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  41.67 
 
 
485 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  41.27 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  45.75 
 
 
493 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
489 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  43.27 
 
 
489 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.4 
 
 
507 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  44.06 
 
 
489 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  44.05 
 
 
425 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  44.05 
 
 
425 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  43.82 
 
 
489 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  41.04 
 
 
485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  43.82 
 
 
489 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  43.82 
 
 
489 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.16 
 
 
476 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  44 
 
 
494 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  39.82 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.05 
 
 
492 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.26 
 
 
486 aa  309  9e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.32 
 
 
491 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  43.28 
 
 
487 aa  293  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.97 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.72 
 
 
473 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.56 
 
 
476 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.48 
 
 
487 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.52 
 
 
487 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  39.25 
 
 
478 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  37.92 
 
 
482 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  37.68 
 
 
482 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.66 
 
 
484 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.47 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  36.18 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  36.11 
 
 
484 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  38.26 
 
 
494 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  38.69 
 
 
478 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.92 
 
 
476 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  38.18 
 
 
485 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.26 
 
 
484 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  38.18 
 
 
485 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  43.97 
 
 
493 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.01 
 
 
492 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
489 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  35.93 
 
 
489 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  37.3 
 
 
478 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  35.93 
 
 
488 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  36.47 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  36.47 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  36.47 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  37.16 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  35.93 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  35.93 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  36.3 
 
 
490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  36.3 
 
 
490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  36.3 
 
 
490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  36.3 
 
 
490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  36.83 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  40.17 
 
 
531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.63 
 
 
484 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  36.23 
 
 
485 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  37.27 
 
 
475 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.94 
 
 
482 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.28 
 
 
491 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  37.39 
 
 
478 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  35.45 
 
 
488 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  35.63 
 
 
488 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.68 
 
 
483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.05 
 
 
477 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.85 
 
 
483 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  32.99 
 
 
492 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  38.83 
 
 
494 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  40.1 
 
 
481 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.1 
 
 
481 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  38.87 
 
 
478 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  36.51 
 
 
479 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.53 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  37.78 
 
 
478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>