More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2872 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
473 aa  918    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  39.28 
 
 
485 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  38.85 
 
 
485 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  38.85 
 
 
485 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  38.85 
 
 
485 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  38.85 
 
 
485 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  38.85 
 
 
485 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.4 
 
 
479 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  39.19 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  39.63 
 
 
487 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  37.79 
 
 
485 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 
489 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 
489 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
487 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
487 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
487 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  38.29 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
485 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  40.21 
 
 
425 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  40.21 
 
 
425 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.75 
 
 
489 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  39.63 
 
 
490 aa  269  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  38.75 
 
 
489 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  36.76 
 
 
485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  38.74 
 
 
486 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  36.44 
 
 
485 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  36.32 
 
 
485 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.53 
 
 
476 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  38.35 
 
 
494 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  39.68 
 
 
493 aa  259  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  38.74 
 
 
486 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  41.83 
 
 
487 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.22 
 
 
486 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.3 
 
 
484 aa  253  7e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.41 
 
 
481 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.82 
 
 
507 aa  242  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  34.95 
 
 
492 aa  240  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.73 
 
 
492 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.26 
 
 
491 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.33 
 
 
476 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  36.28 
 
 
493 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  29.82 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.91 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  30.04 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.91 
 
 
491 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.31 
 
 
498 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.99 
 
 
484 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 
478 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.14 
 
 
487 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  33.78 
 
 
488 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 
478 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.5 
 
 
484 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  33.78 
 
 
488 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  33.78 
 
 
488 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.67 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  37.11 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.51 
 
 
477 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  33.24 
 
 
489 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  30.98 
 
 
476 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  35.64 
 
 
480 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
485 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
490 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
490 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
490 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
490 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
485 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
485 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  32.97 
 
 
488 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  32.97 
 
 
488 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.11 
 
 
483 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  33.16 
 
 
490 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  32.28 
 
 
485 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  31.57 
 
 
489 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  30.98 
 
 
484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  31.33 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  32.9 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  33.87 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.74 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.45 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  35.33 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  35.71 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  31.47 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.09 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.74 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.74 
 
 
491 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.19 
 
 
477 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  32.35 
 
 
533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.1 
 
 
482 aa  183  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.3 
 
 
484 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  32.13 
 
 
494 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  33.05 
 
 
492 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.24 
 
 
489 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  34.24 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>