More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1347 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  100 
 
 
493 aa  956    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  47.06 
 
 
485 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  47.06 
 
 
485 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  47.06 
 
 
485 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  47.06 
 
 
485 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  47.06 
 
 
485 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.54 
 
 
507 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.01 
 
 
485 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  46.01 
 
 
485 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  46.53 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  47.48 
 
 
485 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  46.01 
 
 
485 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  48.64 
 
 
487 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  46.53 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  45.8 
 
 
485 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  46.01 
 
 
485 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  46.53 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  46.01 
 
 
485 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  45.8 
 
 
485 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  45.89 
 
 
485 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  48.12 
 
 
489 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  48.33 
 
 
489 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  48.76 
 
 
486 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  46.72 
 
 
489 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  49.28 
 
 
490 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  45.59 
 
 
485 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  45.38 
 
 
485 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  47.39 
 
 
489 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  46.93 
 
 
489 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  47.39 
 
 
489 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  45.26 
 
 
485 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  46.22 
 
 
485 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.2 
 
 
481 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  47.13 
 
 
425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  47.75 
 
 
494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  47.13 
 
 
425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.73 
 
 
479 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.28 
 
 
476 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  44.97 
 
 
487 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.78 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  38.85 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.85 
 
 
492 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.1 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.28 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.46 
 
 
476 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
476 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.57 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.75 
 
 
487 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.81 
 
 
498 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.42 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.73 
 
 
476 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.98 
 
 
484 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.96 
 
 
491 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.89 
 
 
484 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.01 
 
 
484 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.42 
 
 
492 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.5 
 
 
517 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.26 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.5 
 
 
517 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
493 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.24 
 
 
473 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  39.07 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.1 
 
 
467 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  39.07 
 
 
478 aa  239  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.05 
 
 
511 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
485 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.71 
 
 
477 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.14 
 
 
496 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  41.42 
 
 
527 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.55 
 
 
489 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  34.97 
 
 
476 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  38.38 
 
 
478 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3429  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.05 
 
 
466 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.99 
 
 
521 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0313  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.15 
 
 
469 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.58 
 
 
514 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  37.47 
 
 
479 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0172  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.29 
 
 
466 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.03 
 
 
497 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.38 
 
 
482 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
480 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
524 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.14 
 
 
478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
524 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
524 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.81 
 
 
521 aa  226  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.71 
 
 
464 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  34.66 
 
 
494 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.55 
 
 
482 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  36.95 
 
 
489 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  38.14 
 
 
523 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1476  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.52 
 
 
525 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217094  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.17 
 
 
482 aa  223  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2153  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.58 
 
 
520 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.547893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  37.37 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>