More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3209 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  83.84 
 
 		 489 aa  786    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  98.36 
 
 		 489 aa  947    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  83.64 
 
 		 489 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 489 aa  956    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  75.51 
 
 		 486 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  85.15 
 
 		 487 aa  831    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  84.46 
 
 		 489 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  75.56 
 
 		 494 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  76.28 
 
 		 490 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  75.51 
 
 		 486 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  83.84 
 
 		 489 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  59.71 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  59.71 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  59.71 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  59.13 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  58.09 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  58.09 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  58.71 
 
 		 485 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  58.92 
 
 		 485 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  58.71 
 
 		 485 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  58.09 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  58.09 
 
 		 485 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  58.09 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  57.94 
 
 		 485 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  61.34 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  58.3 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  59.16 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  59.05 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  59.05 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  48.79 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.26 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.61 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.78 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  48.97 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.96 
 
 		 507 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.41 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.27 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.84 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.28 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.75 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.71 
 
 		 476 aa  263  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.7 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.27 
 
 		 484 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.07 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.43 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.34 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.62 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  35.36 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 		 492 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  38.54 
 
 		 527 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.12 
 
 		 487 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.59 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  40.96 
 
 		 527 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.21 
 
 		 489 aa  240  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.38 
 
 		 467 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.63 
 
 		 482 aa  239  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.63 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  36.93 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.04 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.1 
 
 		 491 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.41 
 
 		 572 aa  236  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.8 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  38.07 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.59 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.76 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.91 
 
 		 489 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1162  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.73 
 
 		 530 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  37.98 
 
 		 517 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  37.73 
 
 		 493 aa  232  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.83 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  37.08 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  37.08 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  38.02 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.38 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 		 478 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.03 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.12 
 
 		 482 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  37.6 
 
 		 476 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.08 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  37.74 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  33.87 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  38.48 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.4 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.39 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.97 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.76 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.76 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0313  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.73 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.28 
 
 		 482 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  37.89 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.72 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.34 
 
 		 521 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>