More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2430 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 425 aa  832    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 		 485 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  80.29 
 
 		 487 aa  789    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  80.29 
 
 		 487 aa  789    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  946    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  81.24 
 
 		 485 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  82.06 
 
 		 485 aa  754    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  91.55 
 
 		 485 aa  877    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  946    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  99.59 
 
 		 485 aa  942    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  946    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  81.24 
 
 		 485 aa  766    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  832    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  95.26 
 
 		 485 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  95.26 
 
 		 485 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 487 aa  787    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  99.79 
 
 		 485 aa  944    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  95.46 
 
 		 485 aa  912    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  946    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  95.26 
 
 		 485 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  95.26 
 
 		 485 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  63.12 
 
 		 486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  63.33 
 
 		 486 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  58.35 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  59.18 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  58.35 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  62 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  58.35 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  58.09 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  58.51 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  58.35 
 
 		 490 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  58 
 
 		 494 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.97 
 
 		 476 aa  498  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.84 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.88 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  43.06 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.84 
 
 		 491 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.69 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  47.69 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.81 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.87 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.73 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.56 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.26 
 
 		 476 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.79 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  42.86 
 
 		 527 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.27 
 
 		 498 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 		 493 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  35.71 
 
 		 533 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.7 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.96 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.99 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.46 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.46 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.13 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.46 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  33.97 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  33.97 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  33.97 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.97 
 
 		 511 aa  237  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 		 488 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.79 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 		 494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  37.03 
 
 		 489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.54 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.07 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.09 
 
 		 487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  34.98 
 
 		 488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.23 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.19 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.45 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.17 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1287  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.7 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000180971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.47 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.73 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  32.93 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  33.13 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.65 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  36.93 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  32.99 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  33.12 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  33.05 
 
 		 491 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  37.74 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.04 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  37.74 
 
 		 478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.43 
 
 		 482 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.07 
 
 		 521 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.43 
 
 		 481 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>