More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3296 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  81.13 
 
 		 425 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  952    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  90.33 
 
 		 487 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  80.58 
 
 		 485 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  80.37 
 
 		 485 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  84.09 
 
 		 485 aa  774    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  80.58 
 
 		 485 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  85.54 
 
 		 485 aa  831    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  90.33 
 
 		 487 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  90.12 
 
 		 487 aa  871    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  80.58 
 
 		 485 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  80.58 
 
 		 485 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  85.54 
 
 		 485 aa  830    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  83.47 
 
 		 485 aa  790    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  81.13 
 
 		 425 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  81.61 
 
 		 485 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  82.23 
 
 		 485 aa  802    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  81.4 
 
 		 485 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  65 
 
 		 486 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  65.21 
 
 		 486 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  64.46 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  59.18 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  58.97 
 
 		 489 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  59.18 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  59.13 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  59.13 
 
 		 489 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  59.55 
 
 		 490 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  58.76 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  58.76 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  59.21 
 
 		 494 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.47 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.87 
 
 		 476 aa  501  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  43.58 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.26 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.2 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  47.92 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.84 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.78 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.67 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.6 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.87 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.15 
 
 		 498 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.93 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.15 
 
 		 498 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  40.9 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  35.01 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.32 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.82 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  34.15 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.63 
 
 		 484 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.66 
 
 		 491 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.41 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.93 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.74 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  40.11 
 
 		 527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  36.56 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.17 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.87 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.15 
 
 		 491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.89 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.89 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.31 
 
 		 492 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.09 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.44 
 
 		 494 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.3 
 
 		 521 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.4 
 
 		 477 aa  229  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  37.76 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.38 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  36.64 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  38.82 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.09 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  36.71 
 
 		 527 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 		 481 aa  226  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  35.86 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  36.46 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  32.85 
 
 		 517 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  36.82 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.25 
 
 		 572 aa  224  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  36.83 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  36.83 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.55 
 
 		 511 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  32.24 
 
 		 490 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  32.65 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.86 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  33.48 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  32.91 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  36.86 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.83 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  32.91 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>