More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1025 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
507 aa  978    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.99 
 
 
481 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  44.27 
 
 
487 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  50.66 
 
 
493 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  43.71 
 
 
489 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  43.51 
 
 
489 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  43.71 
 
 
489 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  43.71 
 
 
489 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.47 
 
 
485 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  43.47 
 
 
485 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  43.47 
 
 
485 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  43.47 
 
 
485 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  43.47 
 
 
485 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  44.6 
 
 
486 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  43.27 
 
 
485 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.4 
 
 
479 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  43.4 
 
 
489 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  43.67 
 
 
485 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  42.8 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  41.5 
 
 
487 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  41.5 
 
 
487 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  45.95 
 
 
490 aa  356  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  41.5 
 
 
487 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.68 
 
 
476 aa  355  8.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  44.6 
 
 
486 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  41.99 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.04 
 
 
486 aa  352  7e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  41.87 
 
 
485 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  41.26 
 
 
485 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  41.06 
 
 
485 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  45.52 
 
 
425 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  44.02 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  42.79 
 
 
485 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  40.61 
 
 
487 aa  316  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.27 
 
 
484 aa  303  5.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.17 
 
 
492 aa  282  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  36.73 
 
 
492 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40 
 
 
476 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.99 
 
 
476 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.2 
 
 
491 aa  256  7e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.71 
 
 
487 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40 
 
 
473 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.55 
 
 
484 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.25 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.74 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.98 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  33.84 
 
 
484 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.7 
 
 
498 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  34.06 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.66 
 
 
482 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  33.68 
 
 
476 aa  229  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  37.69 
 
 
479 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1162  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.57 
 
 
530 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
493 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  38.42 
 
 
476 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.99 
 
 
483 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.55 
 
 
482 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.46 
 
 
492 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  36.55 
 
 
478 aa  223  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.26 
 
 
479 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 
480 aa  223  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.98 
 
 
491 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.76 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.76 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.97 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.97 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  36.29 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.1 
 
 
476 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.28 
 
 
483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.93 
 
 
482 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.17 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.7 
 
 
498 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.83 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  35.89 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  38.61 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.71 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  38.02 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  35.37 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.23 
 
 
496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.21 
 
 
511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.55 
 
 
577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  35.8 
 
 
478 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.08 
 
 
481 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.11 
 
 
478 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  33.9 
 
 
524 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  36.97 
 
 
478 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  35.64 
 
 
533 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  31.64 
 
 
478 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.66 
 
 
489 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.83 
 
 
497 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.29 
 
 
489 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  34.32 
 
 
479 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.71 
 
 
511 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>