More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2760 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  80.9 
 
 		 425 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  98.56 
 
 		 485 aa  938    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  84.19 
 
 		 487 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  788    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  80.9 
 
 		 425 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  89.9 
 
 		 485 aa  853    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  80.82 
 
 		 485 aa  789    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  81.44 
 
 		 485 aa  797    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  88.87 
 
 		 485 aa  827    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  84.19 
 
 		 487 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  85.54 
 
 		 485 aa  831    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  80.62 
 
 		 485 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  84.19 
 
 		 487 aa  825    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 485 aa  950    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  62.92 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  59.42 
 
 		 487 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  63.12 
 
 		 486 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  58.97 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  59.18 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  62 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  58.76 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  58.51 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  58.71 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  58.76 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  57.73 
 
 		 490 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  58.21 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.96 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.79 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.15 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  43.53 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.17 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.19 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  46.76 
 
 		 493 aa  349  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.88 
 
 		 479 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.85 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.47 
 
 		 507 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.44 
 
 		 498 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.77 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 		 493 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.48 
 
 		 491 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  35.9 
 
 		 533 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.5 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.76 
 
 		 473 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.59 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.02 
 
 		 489 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.34 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.63 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  41.59 
 
 		 527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.45 
 
 		 487 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.01 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  37.69 
 
 		 482 aa  236  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.25 
 
 		 484 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  37.44 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.75 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.15 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  39.39 
 
 		 517 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.36 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  36.18 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.71 
 
 		 487 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  34.45 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.09 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  31.78 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  31.78 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  36.34 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  31.78 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  34.61 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.46 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  31.78 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  34.61 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  34.61 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.31 
 
 		 494 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  33.33 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  36.83 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  33.25 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  35.03 
 
 		 491 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  37.44 
 
 		 516 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  33.11 
 
 		 517 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.19 
 
 		 572 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  31.36 
 
 		 485 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  33.65 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  38.38 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  34.27 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.35 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  37.08 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  37.5 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  31.98 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  38.95 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.5 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  33.06 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  34.27 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  34.27 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>