More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2682 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
549 aa  1064    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  71.88 
 
 
550 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  60.51 
 
 
516 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  57.56 
 
 
516 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  61.66 
 
 
521 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  57.51 
 
 
525 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  56.75 
 
 
519 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  56.7 
 
 
524 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  56.72 
 
 
511 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  56.41 
 
 
533 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  56.7 
 
 
524 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  52.2 
 
 
531 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  56.7 
 
 
524 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  56.68 
 
 
527 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  56.61 
 
 
523 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  54.15 
 
 
557 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  52.08 
 
 
523 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  54.09 
 
 
517 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  52.54 
 
 
524 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  53.89 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.74 
 
 
572 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  55.19 
 
 
531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  50.59 
 
 
527 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.11 
 
 
515 aa  428  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.5 
 
 
577 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.35 
 
 
601 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.01 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  47.99 
 
 
566 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  45.92 
 
 
595 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.44 
 
 
489 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.15 
 
 
487 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.92 
 
 
484 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.27 
 
 
484 aa  316  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.03 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.13 
 
 
484 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.49 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.1 
 
 
492 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.36 
 
 
489 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.94 
 
 
498 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.42 
 
 
476 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  43.24 
 
 
478 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.69 
 
 
491 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  43.24 
 
 
478 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.34 
 
 
477 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  41.92 
 
 
476 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.03 
 
 
476 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.27 
 
 
483 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  41.92 
 
 
478 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.54 
 
 
491 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.54 
 
 
491 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.54 
 
 
491 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  40.52 
 
 
478 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
485 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  38.77 
 
 
492 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.03 
 
 
475 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.25 
 
 
482 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
490 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
490 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.95 
 
 
500 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
485 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
490 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.37 
 
 
482 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
490 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
485 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
485 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  41.44 
 
 
478 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  39.03 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  39.03 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  39.03 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  39.49 
 
 
488 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  39.19 
 
 
491 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  39.64 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  38.52 
 
 
489 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  40.58 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  39.49 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  42.17 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  40.54 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  40.12 
 
 
478 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  39.95 
 
 
481 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  34.84 
 
 
485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  40.88 
 
 
481 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0376  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.35 
 
 
523 aa  243  6e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  33.93 
 
 
481 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  40.96 
 
 
475 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  38.48 
 
 
490 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.89 
 
 
482 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  35.04 
 
 
485 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  38.22 
 
 
490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.73 
 
 
479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.57 
 
 
498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  35.11 
 
 
478 aa  240  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  42.69 
 
 
487 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.97 
 
 
489 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  34.61 
 
 
485 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.7 
 
 
477 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.46 
 
 
511 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  38.6 
 
 
494 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.59 
 
 
483 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.34 
 
 
482 aa  236  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  37.75 
 
 
479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>