More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0551 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  87.65 
 
 
525 aa  886    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
511 aa  985    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.38 
 
 
521 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.69 
 
 
516 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  58.2 
 
 
519 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  59.73 
 
 
516 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  57.66 
 
 
557 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  56.31 
 
 
533 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  58.17 
 
 
517 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  57.59 
 
 
517 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  56.13 
 
 
523 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  56.24 
 
 
524 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  56.43 
 
 
524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  54.51 
 
 
531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  56.24 
 
 
524 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  55.11 
 
 
523 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  56.52 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  56.23 
 
 
527 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  53.59 
 
 
524 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  54.79 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  60.73 
 
 
515 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.1 
 
 
550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  51.22 
 
 
531 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.12 
 
 
572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.53 
 
 
565 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  50.1 
 
 
566 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.58 
 
 
577 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  47.14 
 
 
595 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.86 
 
 
601 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.79 
 
 
489 aa  356  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.41 
 
 
484 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.49 
 
 
484 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.74 
 
 
487 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  39.53 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.83 
 
 
484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.77 
 
 
487 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.19 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.7 
 
 
489 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  36.45 
 
 
494 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.82 
 
 
483 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.48 
 
 
477 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.63 
 
 
491 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  42.86 
 
 
478 aa  269  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  42.55 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.21 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.02 
 
 
476 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  39.95 
 
 
492 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  37.43 
 
 
478 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.33 
 
 
498 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.44 
 
 
477 aa  263  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  37.67 
 
 
476 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  40.64 
 
 
478 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.8 
 
 
480 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  41.45 
 
 
479 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.12 
 
 
482 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  40.16 
 
 
490 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.7 
 
 
482 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  40.91 
 
 
479 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.93 
 
 
517 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
478 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  40.21 
 
 
493 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.93 
 
 
517 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  35.46 
 
 
481 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  39.89 
 
 
490 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  38.76 
 
 
491 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
478 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  44.04 
 
 
478 aa  256  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  39.79 
 
 
488 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  40.11 
 
 
478 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.67 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  39.95 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  39.73 
 
 
488 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  39.68 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.91 
 
 
514 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  39.68 
 
 
488 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  39.68 
 
 
488 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.45 
 
 
482 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  39.28 
 
 
475 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  38.03 
 
 
485 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37 
 
 
494 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  41.25 
 
 
478 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.32 
 
 
457 aa  250  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  41.67 
 
 
481 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  41.16 
 
 
481 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  42.25 
 
 
479 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
497 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.41 
 
 
479 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  41.04 
 
 
491 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  36.8 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.13 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.63 
 
 
491 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>