More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0294 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  76.22 
 
 
516 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  100 
 
 
516 aa  989    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  69.19 
 
 
521 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  61.12 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  61.02 
 
 
519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  58.71 
 
 
524 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  59.57 
 
 
511 aa  551  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  57.95 
 
 
524 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  57.95 
 
 
524 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  57.84 
 
 
523 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  57.56 
 
 
549 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  57.91 
 
 
557 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  57.36 
 
 
533 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  56.03 
 
 
531 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  57.82 
 
 
527 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  56.41 
 
 
524 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  57.52 
 
 
517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  55.98 
 
 
523 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  57.14 
 
 
517 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.88 
 
 
550 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  55.14 
 
 
531 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.92 
 
 
515 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  53.4 
 
 
527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.65 
 
 
572 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  48.52 
 
 
566 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.52 
 
 
577 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.75 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.53 
 
 
601 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  49.6 
 
 
595 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.56 
 
 
489 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.05 
 
 
484 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.42 
 
 
484 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  39.66 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.36 
 
 
487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.21 
 
 
492 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.53 
 
 
487 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.81 
 
 
484 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.75 
 
 
489 aa  293  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.31 
 
 
491 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.86 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.83 
 
 
476 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.34 
 
 
457 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.66 
 
 
476 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.05 
 
 
477 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.22 
 
 
491 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.22 
 
 
491 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.22 
 
 
491 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  40.56 
 
 
493 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.71 
 
 
489 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.79 
 
 
498 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.78 
 
 
497 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  38.2 
 
 
476 aa  247  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  39.01 
 
 
478 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  39.8 
 
 
478 aa  246  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  37.47 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.18 
 
 
482 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.17 
 
 
511 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  40.26 
 
 
478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.02 
 
 
477 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  36.93 
 
 
490 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.18 
 
 
483 aa  243  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  39.21 
 
 
478 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  36.59 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.59 
 
 
482 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
479 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  36.45 
 
 
494 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.97 
 
 
484 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 
491 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
485 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  39.07 
 
 
485 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
485 aa  237  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.43 
 
 
500 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.21 
 
 
479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.54 
 
 
483 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  37.22 
 
 
488 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  36.62 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  37.44 
 
 
485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  36.96 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  39.21 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  36.96 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  36.96 
 
 
488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.56 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  36.96 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  42.15 
 
 
476 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  40.17 
 
 
497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
487 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
487 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
487 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  36.62 
 
 
489 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  34.61 
 
 
482 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 
485 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 
485 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 
485 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>