More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0552 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
595 aa  1168    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.86 
 
 
601 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.01 
 
 
577 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  52.26 
 
 
531 aa  475  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.95 
 
 
565 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  49.6 
 
 
516 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.49 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  48.23 
 
 
557 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  47.56 
 
 
524 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  44.28 
 
 
531 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  48.28 
 
 
524 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  48.35 
 
 
519 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  48.28 
 
 
524 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.88 
 
 
521 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  47.44 
 
 
525 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  45.89 
 
 
524 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  42.71 
 
 
533 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  45.67 
 
 
523 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  47.47 
 
 
517 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  45.03 
 
 
527 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  46.25 
 
 
523 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  45.51 
 
 
549 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  46.63 
 
 
511 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  46.28 
 
 
517 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  46.93 
 
 
566 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  45.85 
 
 
527 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.25 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.04 
 
 
572 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.09 
 
 
550 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.16 
 
 
489 aa  319  7e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.32 
 
 
484 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.89 
 
 
484 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  40.33 
 
 
484 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.02 
 
 
487 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.18 
 
 
487 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.01 
 
 
491 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.01 
 
 
491 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.74 
 
 
491 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.95 
 
 
489 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.63 
 
 
484 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.28 
 
 
505 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.56 
 
 
457 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.68 
 
 
476 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.48 
 
 
498 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.48 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.57 
 
 
491 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  38.42 
 
 
476 aa  233  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.93 
 
 
467 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.1 
 
 
464 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.89 
 
 
492 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  37.2 
 
 
480 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.53 
 
 
483 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.1 
 
 
476 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  35.77 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  35.77 
 
 
478 aa  223  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.84 
 
 
500 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.69 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  36.9 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
485 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.12 
 
 
485 aa  220  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
485 aa  220  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  35.88 
 
 
478 aa  220  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
485 aa  220  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
485 aa  220  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
485 aa  220  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  39.12 
 
 
425 aa  220  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  39.12 
 
 
425 aa  220  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.36 
 
 
478 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.81 
 
 
498 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  34.7 
 
 
489 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  38.84 
 
 
485 aa  219  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  34.46 
 
 
489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  37.57 
 
 
476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  32.06 
 
 
506 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  34.46 
 
 
489 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.64 
 
 
477 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.81 
 
 
479 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  32.4 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  34.86 
 
 
487 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  36.8 
 
 
485 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  36.27 
 
 
485 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  37.54 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  37.54 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  35.31 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  34.22 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  37.36 
 
 
475 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
485 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.99 
 
 
482 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
485 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
485 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.38 
 
 
497 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
485 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  37.22 
 
 
478 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 
482 aa  213  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  37.64 
 
 
485 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5415  NADH dehydrogenase subunit N  34.95 
 
 
506 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.12 
 
 
517 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  36.93 
 
 
479 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  38.25 
 
 
485 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  31.31 
 
 
492 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>