More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1930 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
497 aa  974    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  44.28 
 
 
484 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.21 
 
 
487 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.92 
 
 
487 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.33 
 
 
484 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.01 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.91 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.19 
 
 
492 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.43 
 
 
476 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
491 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.76 
 
 
489 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  40.58 
 
 
476 aa  286  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.68 
 
 
476 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.49 
 
 
457 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.71 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.64 
 
 
491 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.64 
 
 
491 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.64 
 
 
491 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.73 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000633483  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  40.74 
 
 
479 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.94 
 
 
511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.09 
 
 
483 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.35 
 
 
479 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  35.37 
 
 
531 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.58 
 
 
467 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  37.5 
 
 
480 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.86 
 
 
476 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
488 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
489 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
488 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
488 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.14 
 
 
511 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.53 
 
 
513 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.74 
 
 
482 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
488 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  37.01 
 
 
492 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
488 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.07 
 
 
500 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
485 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.76 
 
 
477 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
490 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
490 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
490 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
485 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
490 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
485 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  38.9 
 
 
485 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  37.24 
 
 
490 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.32 
 
 
511 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 
498 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  38.63 
 
 
491 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  38.1 
 
 
493 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2581  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.94 
 
 
516 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0861426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  38.92 
 
 
478 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.89 
 
 
483 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.09 
 
 
511 aa  256  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  42.78 
 
 
516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.64 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  39.96 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  37.74 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.01 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  41.14 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  39.72 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.15 
 
 
482 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1267  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.14 
 
 
516 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.27 
 
 
464 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.14 
 
 
516 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.58 
 
 
511 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0376  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.55 
 
 
523 aa  253  7e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  36.15 
 
 
482 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  36.05 
 
 
485 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.29 
 
 
482 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  38.11 
 
 
478 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  38.11 
 
 
478 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  40.28 
 
 
527 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  38.3 
 
 
494 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  34.76 
 
 
492 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  42.71 
 
 
487 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
533 aa  249  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  37.85 
 
 
481 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0190823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.92 
 
 
521 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  35.88 
 
 
506 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  35.64 
 
 
485 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  38.11 
 
 
481 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0714  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.75 
 
 
503 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.760446  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0817  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.53 
 
 
485 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  35.17 
 
 
478 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  35.88 
 
 
506 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4972  NADH dehydrogenase subunit N  35.49 
 
 
506 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  35.38 
 
 
479 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38 
 
 
479 aa  247  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  40.56 
 
 
524 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.77 
 
 
489 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  39.89 
 
 
524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  42.94 
 
 
527 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.4 
 
 
477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  39.89 
 
 
524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.86 
 
 
496 aa  246  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.57 
 
 
481 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>