More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1108 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
486 aa  913    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  48.35 
 
 
487 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
489 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
489 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  46.88 
 
 
485 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
489 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  47.81 
 
 
486 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  48.02 
 
 
486 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  45.83 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  45.83 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  45.83 
 
 
487 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  44.35 
 
 
485 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  46.56 
 
 
489 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  46.79 
 
 
485 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  47.08 
 
 
489 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  46.79 
 
 
485 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  46.6 
 
 
485 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  46.46 
 
 
485 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  46.6 
 
 
485 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.52 
 
 
476 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  44.77 
 
 
485 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  46.79 
 
 
485 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.06 
 
 
485 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  48.24 
 
 
490 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  46.06 
 
 
485 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  46.06 
 
 
485 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  46.06 
 
 
485 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.78 
 
 
507 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  45.85 
 
 
485 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  46.06 
 
 
485 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  44.38 
 
 
485 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  45.64 
 
 
485 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.94 
 
 
481 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  45 
 
 
485 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  51.45 
 
 
493 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  48.25 
 
 
494 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  48.3 
 
 
487 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.81 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  48.23 
 
 
425 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  48.23 
 
 
425 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.63 
 
 
484 aa  323  3e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  41.46 
 
 
492 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.69 
 
 
492 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.41 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 
493 aa  276  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.4 
 
 
491 aa  276  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.54 
 
 
476 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.33 
 
 
476 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.33 
 
 
487 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  40.16 
 
 
484 aa  249  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.61 
 
 
487 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.78 
 
 
483 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.76 
 
 
484 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.42 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.55 
 
 
484 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.77 
 
 
484 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.63 
 
 
498 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.64 
 
 
482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.99 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  36.09 
 
 
476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.76 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.7 
 
 
477 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.05 
 
 
489 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  36.52 
 
 
482 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.29 
 
 
491 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.09 
 
 
478 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.6 
 
 
492 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.63 
 
 
498 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.45 
 
 
511 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 
479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04971  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.69 
 
 
506 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 
480 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  32.62 
 
 
494 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.46 
 
 
491 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.46 
 
 
491 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.69 
 
 
489 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0434  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.21 
 
 
506 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.96 
 
 
491 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
490 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1767  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.71 
 
 
520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.506609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.06 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.21 
 
 
506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.3 
 
 
482 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.93 
 
 
511 aa  223  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  34.84 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  35.17 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  39.25 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.62 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  35.17 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  34.94 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  35.17 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  36.41 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.8 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>