More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1636 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0641  NADH dehydrogenase (quinone)  99.78 
 
 
463 aa  914    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1636  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
463 aa  914    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3180  NADH dehydrogenase (quinone)  99.35 
 
 
463 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.58 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.41 
 
 
505 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.76 
 
 
489 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  31.64 
 
 
476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.56 
 
 
477 aa  196  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.15 
 
 
476 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.93 
 
 
483 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.58 
 
 
511 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  33.62 
 
 
479 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.73 
 
 
476 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.21 
 
 
483 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.33 
 
 
464 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  32.63 
 
 
454 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  40.88 
 
 
493 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  32.56 
 
 
479 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.43 
 
 
487 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  31.85 
 
 
478 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.1 
 
 
493 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.55 
 
 
511 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.8 
 
 
477 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  32.34 
 
 
478 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.22 
 
 
491 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0922  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.52 
 
 
482 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.49 
 
 
511 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  33.13 
 
 
478 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.16 
 
 
479 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  33.13 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.64 
 
 
489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.26 
 
 
511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.06 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000633483  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  29.93 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  32.98 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.44 
 
 
513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.24 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.5 
 
 
484 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  33.1 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  31.31 
 
 
494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  29.95 
 
 
506 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  34.76 
 
 
497 aa  183  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.33 
 
 
498 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.88 
 
 
489 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  34.88 
 
 
489 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  30.47 
 
 
492 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.76 
 
 
482 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.63 
 
 
482 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
489 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  33.08 
 
 
478 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  34.68 
 
 
478 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  32.02 
 
 
497 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  34.68 
 
 
478 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5088  NADH dehydrogenase subunit N  31.53 
 
 
506 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  35.47 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  32.73 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  31.34 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 
489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  31.38 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  31.92 
 
 
476 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  32.97 
 
 
497 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  29.73 
 
 
506 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5415  NADH dehydrogenase subunit N  30.41 
 
 
506 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.92 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.07 
 
 
492 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.31 
 
 
487 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.51 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.88 
 
 
467 aa  180  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.51 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.51 
 
 
491 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  32.14 
 
 
478 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  28.77 
 
 
479 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  31.12 
 
 
482 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  30.65 
 
 
478 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.33 
 
 
484 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  31.27 
 
 
481 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  29.6 
 
 
478 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.37 
 
 
511 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  33.13 
 
 
481 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1935  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.82 
 
 
472 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.758736  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  34.07 
 
 
489 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  28.81 
 
 
469 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  33.13 
 
 
495 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.67 
 
 
482 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.13 
 
 
482 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  31.33 
 
 
531 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  33.43 
 
 
478 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  32.58 
 
 
487 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.53 
 
 
527 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  32.75 
 
 
485 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.34 
 
 
481 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  33.72 
 
 
485 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.05 
 
 
492 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0885  NADH dehydrogenase subunit N  34.21 
 
 
497 aa  176  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3429  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.01 
 
 
466 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  32.75 
 
 
490 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  32.75 
 
 
490 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  32.75 
 
 
490 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>