209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0910 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  53.66 
 
 		 716 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  47.64 
 
 		 738 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  56.22 
 
 		 722 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  54.23 
 
 		 716 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.2 
 
 		 717 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  50.23 
 
 		 717 aa  211  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  51.63 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.22 
 
 		 717 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.39 
 
 		 722 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  47.25 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.39 
 
 		 722 aa  198  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.59 
 
 		 713 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.21 
 
 		 712 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  46.94 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  48.84 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  45.87 
 
 		 704 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  43.66 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.78 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  40.83 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  43.84 
 
 		 713 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  46.61 
 
 		 720 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  40.58 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.04 
 
 		 746 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.23 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  40.6 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  42.4 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  46.94 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  41.04 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  38.68 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  38.97 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.05 
 
 		 705 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.05 
 
 		 714 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  37.22 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  31.1 
 
 		 714 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  36.52 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  34.66 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  37.64 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  35.84 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.8 
 
 		 320 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  37.59 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  37.58 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  38.13 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  32.61 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  32.84 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  31.96 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.94 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  32.84 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  31.51 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.25 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  34.62 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.22 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  36.15 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  36.03 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.78 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.16 
 
 		 623 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.01 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.93 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  32.79 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.57 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.84 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.38 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  32.87 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  31.67 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>