More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0666 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 311 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  67.67 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.09 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.16 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.16 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  63.7 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  68.53 
 
 		 288 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  65.75 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  68.07 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  66.8 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  62.8 
 
 		 299 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  61.51 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  56.98 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  56.98 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  56.93 
 
 		 280 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  60.42 
 
 		 279 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  60.64 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.7 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  50.36 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.67 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  58 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.76 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.76 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  48.79 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  43.9 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.15 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  44.34 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.31 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.16 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.53 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  47.46 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  40.07 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  46.3 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.76 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  43.42 
 
 		 287 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  43.12 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  45.22 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.85 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  47.06 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  45.41 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.06 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.04 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.81 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  42.35 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.85 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.35 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.3 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.87 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  47.19 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.3 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  45.7 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  43.89 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.83 
 
 		 281 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  43.17 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 		 256 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  42.29 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.91 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  43.42 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  30.87 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  30.87 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  31.76 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.57 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  33.48 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.09 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>