73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1723 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  733    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.51 
 
 
389 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3052  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 
956 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.72 
 
 
665 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.78 
 
 
618 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
652 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 
774 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.15 
 
 
613 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.74 
 
 
779 aa  59.3  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  23.08 
 
 
776 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.3 
 
 
673 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 
619 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 
905 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
772 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 
673 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.82 
 
 
790 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 
606 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
636 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  26.84 
 
 
639 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 
765 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.62 
 
 
636 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 
619 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  26 
 
 
797 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 
613 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.12 
 
 
762 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 
834 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  26.92 
 
 
736 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
785 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.08 
 
 
688 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.12 
 
 
553 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.27 
 
 
655 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
673 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.12 
 
 
777 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.86 
 
 
618 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.31 
 
 
589 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.46 
 
 
493 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.94 
 
 
571 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  22.85 
 
 
599 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  26.13 
 
 
503 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.63 
 
 
778 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.83 
 
 
760 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  32.38 
 
 
795 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.6 
 
 
766 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.16 
 
 
627 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.28 
 
 
605 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.08 
 
 
843 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
609 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 
779 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.77 
 
 
699 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
639 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.12 
 
 
683 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  25.84 
 
 
640 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.76 
 
 
515 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 
549 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  21.86 
 
 
631 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
811 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.36 
 
 
476 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.13 
 
 
526 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  25.14 
 
 
640 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.72 
 
 
794 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.29 
 
 
711 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.85 
 
 
634 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
593 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.25 
 
 
643 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.06 
 
 
781 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
556 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.3 
 
 
504 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  27.92 
 
 
602 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.88 
 
 
469 aa  42.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 
527 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>