More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1023 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  66.17 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  68.22 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  61.36 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  59.69 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  55.28 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  54.47 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  44.96 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  44.19 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  43.08 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  44.19 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  34.04 
 
 		 646 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  36.97 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  33.09 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  31.39 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  30.66 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  34.88 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  32.31 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  29.23 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  28.47 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  31.62 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  33.94 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 734 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  30.53 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  26.15 
 
 		 722 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  32 
 
 		 730 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  27.48 
 
 		 720 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  27.48 
 
 		 720 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  32 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  39.77 
 
 		 208 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  32.11 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  26.72 
 
 		 738 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  27.69 
 
 		 754 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  28.8 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11523  methylmalonyl-CoA mutase  28.46 
 
 		 750 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.26728 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  31.06 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35 
 
 		 733 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2238  methylmalonyl-CoA mutase  26.92 
 
 		 722 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  29.55 
 
 		 732 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  25.56 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  34.44 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  25.58 
 
 		 720 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2763  methylmalonyl-CoA mutase  28.46 
 
 		 751 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0863781  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  25.38 
 
 		 719 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.81 
 
 		 246 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  37.5 
 
 		 251 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  25.38 
 
 		 731 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  24.62 
 
 		 719 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  24.81 
 
 		 719 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  24.81 
 
 		 723 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  37.5 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  28.12 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  26.15 
 
 		 720 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  27.82 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  24.81 
 
 		 718 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  37.36 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.91 
 
 		 745 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4569  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 703 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.365134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  33.66 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  23.53 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  26.87 
 
 		 725 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.03 
 
 		 727 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  25.58 
 
 		 724 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  30.51 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.17 
 
 		 688 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2420  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.28 
 
 		 763 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  27.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  24.62 
 
 		 718 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  25.38 
 
 		 719 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  25.38 
 
 		 718 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  25.58 
 
 		 714 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  24.81 
 
 		 739 aa  48.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  37.7 
 
 		 1167 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3649  methylmalonyl-CoA mutase  26.83 
 
 		 752 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  31.46 
 
 		 1168 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  36.26 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  29.03 
 
 		 715 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  31.18 
 
 		 804 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  35.63 
 
 		 1156 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  26.28 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  24.62 
 
 		 736 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.22 
 
 		 873 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>