82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1481 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  69.51 
 
 		 728 aa  1030    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  68.58 
 
 		 733 aa  1034    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  70.76 
 
 		 730 aa  1078    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  67.39 
 
 		 732 aa  1037    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  70.52 
 
 		 745 aa  1055    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 734 aa  1512    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3888  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.04 
 
 		 518 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  37.34 
 
 		 251 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  36.29 
 
 		 263 aa  132  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 261 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0203  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  29.74 
 
 		 516 aa  130  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.3169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1906  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit, D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.62 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1073  D-lysine 5,6-aminomutase, alpha subunit  29.6 
 
 		 523 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.720029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 261 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0196  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.32 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  33.9 
 
 		 246 aa  121  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1084  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.98 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 265 aa  118  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  34.58 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3950  D-Lysine 56-aminomutase subunit alpha  27.99 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2384  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  27.97 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224895  hitchhiker  0.00032654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2265  hypothetical protein  27.7 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00000065205  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2663  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  26.22 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  30.98 
 
 		 255 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  30.98 
 
 		 255 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  30.45 
 
 		 255 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 248 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2384  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.12 
 
 		 524 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2472  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.12 
 
 		 524 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1483  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  25.79 
 
 		 524 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2349  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  25.34 
 
 		 523 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320388  normal  0.0638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 254 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 260 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  30.43 
 
 		 255 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  32.08 
 
 		 267 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.09 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.06 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 219 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  33.67 
 
 		 139 aa  54.7  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  33.33 
 
 		 259 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  29.55 
 
 		 139 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 219 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  32 
 
 		 144 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  32.52 
 
 		 149 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  31.4 
 
 		 210 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  30 
 
 		 210 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  32.46 
 
 		 213 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 133 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  48.9  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  26.97 
 
 		 216 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.03 
 
 		 841 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  27.41 
 
 		 232 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  27.41 
 
 		 232 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  32.43 
 
 		 212 aa  48.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  34.69 
 
 		 146 aa  47.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  32.98 
 
 		 136 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  29.17 
 
 		 158 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  28.7 
 
 		 224 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  29.2 
 
 		 804 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  34.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  27.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  25.56 
 
 		 216 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.73 
 
 		 802 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  28.32 
 
 		 218 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.92 
 
 		 217 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  32.14 
 
 		 1239 aa  45.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  29.17 
 
 		 210 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  27.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  29.73 
 
 		 232 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  32.26 
 
 		 219 aa  44.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  29.17 
 
 		 210 aa  44.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  29.69 
 
 		 804 aa  44.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  26.67 
 
 		 232 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  27.91 
 
 		 251 aa  44.3  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0082  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 541 aa  44.3  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.566205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  30.61 
 
 		 133 aa  43.9  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  32.11 
 
 		 1269 aa  43.9  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31 
 
 		 139 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>