52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1085 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  73.36 
 
 		 261 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  68.97 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  69.35 
 
 		 261 aa  384  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  61.67 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  54.2 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  48.13 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  48.13 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  47.72 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  48.12 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  44.9 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.04 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.28 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  40.83 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35 
 
 		 733 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 734 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  32.63 
 
 		 730 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  33.47 
 
 		 732 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 728 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  31.74 
 
 		 745 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2142  corrinoid protein  34.93 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142295  normal  0.350048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.65 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  30.46 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  31.3 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  28.39 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  30.34 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  30.43 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  30.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  25.32 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.65 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  30.34 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  32.56 
 
 		 804 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  31.96 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  25.29 
 
 		 1196 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.29 
 
 		 800 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  29.29 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  27.21 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  26.9 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  26.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  29.03 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  35.44 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  25.25 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  26.09 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.93 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  27.22 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  32.91 
 
 		 801 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  30 
 
 		 216 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>