61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1170 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  77.72 
 
 		 728 aa  1192    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  65.19 
 
 		 730 aa  1013    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  60.77 
 
 		 745 aa  897    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  67.39 
 
 		 734 aa  1037    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  100 
 
 		 732 aa  1509    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  77.02 
 
 		 733 aa  1197    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1073  D-lysine 5,6-aminomutase, alpha subunit  30.57 
 
 		 523 aa  139  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.720029 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0203  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.61 
 
 		 516 aa  127  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.3169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3888  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.31 
 
 		 518 aa  127  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1906  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit, D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.03 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0196  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  30.87 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  33.88 
 
 		 263 aa  121  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2663  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  28.69 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  33.76 
 
 		 246 aa  119  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 261 aa  118  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1084  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.45 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 265 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3950  D-Lysine 56-aminomutase subunit alpha  28.48 
 
 		 525 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2384  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.61 
 
 		 520 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224895  hitchhiker  0.00032654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2265  hypothetical protein  28.32 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00000065205  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  32.62 
 
 		 251 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2384  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.51 
 
 		 524 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2472  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.39 
 
 		 524 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2349  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  25.86 
 
 		 523 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320388  normal  0.0638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  28.23 
 
 		 251 aa  92.8  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 248 aa  90.9  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  28.02 
 
 		 255 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  28.02 
 
 		 255 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1483  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  25.86 
 
 		 524 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  28.57 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  29.13 
 
 		 255 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  28.16 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.16 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 219 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  32.17 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 219 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  31.07 
 
 		 210 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  30.77 
 
 		 149 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  34.62 
 
 		 213 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  30.07 
 
 		 149 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  32.38 
 
 		 144 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  29.86 
 
 		 146 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  31.63 
 
 		 139 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  33.03 
 
 		 212 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  33.9 
 
 		 137 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 218 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  30.19 
 
 		 210 aa  44.3  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  30.48 
 
 		 218 aa  44.3  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  30.19 
 
 		 210 aa  44.3  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  30.53 
 
 		 216 aa  44.3  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 210 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  33.98 
 
 		 217 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 216 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  29.36 
 
 		 221 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  25.54 
 
 		 804 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  31.19 
 
 		 220 aa  44.3  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.66 
 
 		 214 aa  43.9  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>