20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2265 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2384  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  97.31 
 
 		 520 aa  891    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224895  hitchhiker  0.00032654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3950  D-Lysine 56-aminomutase subunit alpha  76.8 
 
 		 525 aa  771    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2265  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1038    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00000065205  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2663  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  78.65 
 
 		 526 aa  799    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3888  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  54.44 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0203  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  51.26 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.3169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1906  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit, D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  49.81 
 
 		 523 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1084  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  48.04 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1073  D-lysine 5,6-aminomutase, alpha subunit  49.9 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.720029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2349  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  51.95 
 
 		 523 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320388  normal  0.0638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2384  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  52.71 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2472  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  52.71 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0196  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  48.05 
 
 		 520 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1483  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  53.2 
 
 		 524 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.32 
 
 		 732 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.79 
 
 		 734 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  28.37 
 
 		 730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 733 aa  111  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 728 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.84 
 
 		 745 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>