124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1594 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  89.04 
 
 		 151 aa  260  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  73.29 
 
 		 146 aa  226  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  76.76 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  52.63 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  54.81 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  51.13 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  51.54 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  43.88 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  43.17 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  44.19 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  37.8 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  34.07 
 
 		 646 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  43.1 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  32.56 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  28.24 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  26.09 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  28.24 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  30.61 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  26.56 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  25.78 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  28.09 
 
 		 1156 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  28.8 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.95 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.95 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  31.87 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  27.78 
 
 		 140 aa  47.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  31.09 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  29.89 
 
 		 1251 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  32.26 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.66 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.23 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.6 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  26.74 
 
 		 1178 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  27.06 
 
 		 1208 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  29.89 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  31.25 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  28.95 
 
 		 607 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1220 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1264 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2157  2-methyleneglutarate mutase  40.32 
 
 		 616 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.937034  normal  0.527767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  27.34 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  31.91 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  29.69 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1264 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 265 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  31.34 
 
 		 246 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  30.23 
 
 		 1169 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  29.47 
 
 		 216 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  27.59 
 
 		 1243 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1251 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  27.48 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  31.68 
 
 		 745 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  33 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  35.59 
 
 		 1158 aa  43.5  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2332  methylmalonyl-CoA mutase  29.49 
 
 		 1146 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.43 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  30.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  31.88 
 
 		 267 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.97 
 
 		 1163 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  31.85 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  26.4 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  29.63 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  31.11 
 
 		 255 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06870  methylmalonyl-CoA mutase  24.17 
 
 		 1139 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  25.58 
 
 		 1136 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  33.33 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.59 
 
 		 800 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  26.4 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  31.11 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  23.08 
 
 		 1191 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  23.08 
 
 		 1191 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.79 
 
 		 210 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.91 
 
 		 873 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  22.48 
 
 		 153 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  22.45 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.74 
 
 		 1263 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  41.18 
 
 		 251 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  29.07 
 
 		 1236 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  25.58 
 
 		 1187 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  29.07 
 
 		 804 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.02 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  25.58 
 
 		 894 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  30.51 
 
 		 1173 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  25.29 
 
 		 1176 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2142  corrinoid protein  28.3 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142295  normal  0.350048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  32.2 
 
 		 1181 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>