117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3334 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  100 
 
 		 151 aa  299  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  89.04 
 
 		 146 aa  260  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  74.66 
 
 		 146 aa  229  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  73.94 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  51.88 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  55.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  50.38 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  50 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  45.04 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  44.27 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  43.08 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  36.23 
 
 		 646 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  37.8 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  40.65 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  32.56 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  24.79 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  27.34 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  26.56 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  30.09 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  25.78 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  29.59 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  27.34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.23 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  31.45 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  31.19 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  30.16 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  30.68 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  30.68 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  28.23 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06870  methylmalonyl-CoA mutase  26.61 
 
 		 1139 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  31.65 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  26.37 
 
 		 1156 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  27.78 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  29.84 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  32.09 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  30.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  31.71 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  27.2 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2332  methylmalonyl-CoA mutase  25 
 
 		 1146 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1220 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1264 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2157  2-methyleneglutarate mutase  39.71 
 
 		 616 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.937034  normal  0.527767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  35.59 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  27.14 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 265 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  32.62 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1264 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.77 
 
 		 745 aa  44.3  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  31.07 
 
 		 1169 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  27.59 
 
 		 1243 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  25.58 
 
 		 1178 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.16 
 
 		 607 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  41.67 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  35.59 
 
 		 1158 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  29.63 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1251 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  27.59 
 
 		 1251 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  28.15 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  29.89 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  24.07 
 
 		 1158 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.57 
 
 		 1163 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  33.33 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.79 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4277  methylmalonyl-CoA mutase  37.68 
 
 		 1272 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.09 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0431  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  37.68 
 
 		 1298 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  27.34 
 
 		 811 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  34.43 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  27.34 
 
 		 813 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  26.32 
 
 		 1208 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  32.22 
 
 		 212 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25 
 
 		 734 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  31.87 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  29.79 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  32.76 
 
 		 819 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  28.99 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3448  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.33 
 
 		 1086 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  26.44 
 
 		 913 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  25.81 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  28.12 
 
 		 712 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  26.02 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3630  methylmalonyl-CoA mutase  32.69 
 
 		 717 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  22.12 
 
 		 1191 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  22.12 
 
 		 1191 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  30.88 
 
 		 255 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>