More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0885 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0885  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.88 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  30.37 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.58 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.57 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.6 
 
 		 655 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  24.53 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.44 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  27.56 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  29.73 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  26.85 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  29.3 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  29.21 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.61 
 
 		 680 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.67 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  32.58 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  26.29 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.54 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  26.39 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  29.35 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  29.51 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.11 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.98 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  49.28 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  32.08 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.11 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  25.58 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  27.64 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  25.58 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.11 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.91 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.43 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  28.78 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.57 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  25.71 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  30.41 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.66 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.83 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.47 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  27.57 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  24.55 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.64 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  25.98 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  28.64 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.46 
 
 		 598 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  31.12 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  30.94 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  30.94 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.1 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  29.63 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  42.05 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  24.55 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  30.16 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  29.08 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  28.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  27.51 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.44 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  27.6 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 		 594 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  24.65 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  26.39 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  39.36 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  32.38 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  28.27 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  24.47 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  31.02 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>