More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13073 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  100 
 
 		 346 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  68.3 
 
 		 357 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  73.98 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  73.98 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  73.98 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  70.5 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  55 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  53.42 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  51.31 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  52.35 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  49.86 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  50.15 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  49.56 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  47.94 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  35.77 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.98 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.1 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.95 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  35.11 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.1 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.94 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.07 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.76 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  32.44 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.1 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  37.87 
 
 		 399 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  34.35 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.27 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  34.59 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  32.15 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.23 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  32.43 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.48 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.16 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.22 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.69 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  35.86 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.41 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.71 
 
 		 489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 409 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.24 
 
 		 454 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  31.74 
 
 		 381 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  30.79 
 
 		 410 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.21 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  34.31 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.12 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  30.59 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.01 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  34.6 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.9 
 
 		 363 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.21 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 420 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  32.25 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  35.87 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  35.38 
 
 		 466 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 		 430 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  35.38 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  37.72 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  30.17 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  35.49 
 
 		 431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.38 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>