More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2509 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  54.63 
 
 
218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  51.85 
 
 
233 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  51.85 
 
 
233 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  53.7 
 
 
217 aa  227  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  48.84 
 
 
215 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  52.07 
 
 
245 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  46.51 
 
 
234 aa  207  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  25.43 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  33.85 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.17 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.62 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.71 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  35.78 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.96 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  28.15 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.62 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  37.14 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25.12 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  26.78 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  26.76 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  40.74 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.65 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  39.02 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  36.47 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5896  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.78 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.3 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.13 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.01 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  30.28 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  41.67 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.47 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.96 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  34.86 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  40.24 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.65 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.71 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.09 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  23.04 
 
 
300 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.51 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  41.38 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.11 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.72 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  29.01 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.94 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.25 
 
 
268 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  23.26 
 
 
300 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
272 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  30.22 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.06 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
251 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  24.29 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.38 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.38 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  40.3 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04572  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 
327 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116714  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  28.91 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.91 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.38 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  28.91 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  32.65 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.91 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  28.91 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.85 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  31.15 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  31.15 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  35.29 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>