More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1424 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1424  ATPase  100 
 
 
330 aa  665    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0734659 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  73.6 
 
 
324 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  61.06 
 
 
322 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  41.83 
 
 
353 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  41.88 
 
 
353 aa  268  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  43.77 
 
 
344 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  42.39 
 
 
350 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  42.6 
 
 
336 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.26 
 
 
362 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  47.46 
 
 
358 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.11 
 
 
360 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.7 
 
 
360 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  42.61 
 
 
355 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  43.69 
 
 
333 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  41.52 
 
 
361 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  41.64 
 
 
362 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  47.92 
 
 
359 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.57 
 
 
352 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  46.02 
 
 
354 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
361 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  39.48 
 
 
361 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
360 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  42.09 
 
 
368 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  41.76 
 
 
356 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  40.06 
 
 
369 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  41.33 
 
 
351 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  40.23 
 
 
355 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  48.46 
 
 
360 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  48.25 
 
 
366 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  40.62 
 
 
361 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  42.74 
 
 
348 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  42.74 
 
 
348 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  40.11 
 
 
356 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  42.74 
 
 
348 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  41.24 
 
 
356 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  40 
 
 
338 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  38.48 
 
 
358 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.07 
 
 
332 aa  255  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  50.21 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  47.22 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  45.14 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  39.83 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
361 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  38.48 
 
 
363 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  39.11 
 
 
361 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.97 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  50 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  40.94 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  52.07 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  41.23 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  44.55 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
333 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
369 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1694  hypothetical protein  38.2 
 
 
363 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  39.04 
 
 
356 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  45.02 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  50.61 
 
 
362 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  50.88 
 
 
353 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  41.46 
 
 
350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  42.77 
 
 
333 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  40.67 
 
 
368 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  41.46 
 
 
350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  45.7 
 
 
399 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  41.46 
 
 
350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.24 
 
 
357 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  42.28 
 
 
334 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
333 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  47.93 
 
 
369 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  47.52 
 
 
369 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
369 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.1 
 
 
359 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  48.47 
 
 
333 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  40.23 
 
 
349 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  46.92 
 
 
368 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 
332 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.08 
 
 
370 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  39.71 
 
 
349 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 
367 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
368 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.11 
 
 
369 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  50.2 
 
 
362 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
357 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
362 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  42.59 
 
 
332 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  42.28 
 
 
333 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  50 
 
 
349 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  41.05 
 
 
332 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.23 
 
 
358 aa  249  5e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.14 
 
 
359 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  47.08 
 
 
366 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  40.16 
 
 
368 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  42.16 
 
 
355 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 
333 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
369 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
369 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
369 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
369 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
369 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  39.77 
 
 
354 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>