160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1186 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  62.26 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16141  hypothetical protein  52.78 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.21518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  40.45 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.66 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  31.13 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  37.74 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41.03 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  50 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.89 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  34.41 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  34.41 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  34.69 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  37.66 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.03 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  29.06 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  29.36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.71 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  36.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.65 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  41.3 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  34.55 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  29.31 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  33.98 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  40.48 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  41.25 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.64 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  39.51 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  32.08 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  45.1 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.19 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  38.61 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  31.07 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  39.74 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  37.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  32.04 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  29 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  40.24 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  44.64 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  49.02 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  46.43 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  32.67 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  28.57 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  41.89 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.58 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.54 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.1 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  37.8 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  44.23 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  32.29 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  28 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.82 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  32.22 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  49.06 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  49.06 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  28.28 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  26.74 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  38.27 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  25.61 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  23.81 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  35.62 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  25.61 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  24.39 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.87 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  40.74 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.87 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  39.24 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  28.92 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.04 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.37 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.37 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  31.17 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  31.33 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>