More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0855 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  895    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  70.54 
 
 		 452 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  66.9 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  57.85 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  57.85 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  58.06 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  50.58 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  50.12 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  49.42 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  48.4 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  42.63 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  39.27 
 
 		 446 aa  279  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  37.76 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  37.76 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  34.93 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  37.35 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  38.81 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  36.98 
 
 		 469 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.81 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  37.5 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  37.07 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  40.38 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  36.01 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  36.78 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  31.7 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.54 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1024 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1024 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  22.51 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.64 
 
 		 409 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.41 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.58 
 
 		 470 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.48 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.87 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.48 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.48 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.84 
 
 		 890 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  26.82 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 		 989 aa  87  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.2 
 
 		 485 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  25.72 
 
 		 499 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.91 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.1 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  32.39 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.48 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.05 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  24.89 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.72 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  31.52 
 
 		 1000 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  24.89 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  29.78 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.28 
 
 		 887 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 983 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.54 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.92 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  30.58 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  28.64 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  30.23 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  24 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  25.35 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  23.81 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.29 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  24.73 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  25.88 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  24.46 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  32.02 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>