124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3938 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  100 
 
 		 505 aa  1050    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  52.93 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  44.31 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  44.91 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  45.18 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  43.9 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  45.09 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  43.98 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  43.6 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  43.53 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  42.86 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  41.77 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  42.62 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  41.83 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  42.25 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  42.05 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  42.25 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  42.25 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  41.82 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  43.9 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  41.96 
 
 		 740 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  42.04 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  42.37 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  42.02 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  42.11 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  41.78 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  41.97 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  42.39 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  43.22 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  41.87 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  43.15 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  43.09 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  43.15 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.24 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  42.57 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  42.54 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  41.45 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  42.31 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  41.94 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  40.62 
 
 		 518 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  39.92 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  41.46 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  42.65 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  41.25 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  41.02 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  40.28 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  40.04 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  38.45 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  39.64 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  38.51 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  41.37 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  39.76 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  37.8 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  37.5 
 
 		 523 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  38.7 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  35.79 
 
 		 499 aa  289  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  35.26 
 
 		 517 aa  266  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.65 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.28 
 
 		 538 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.28 
 
 		 538 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.49 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.49 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 527 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  37.9 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 524 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.95 
 
 		 526 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.7 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.43 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.73 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.89 
 
 		 524 aa  236  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 501 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 514 aa  233  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 503 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  31.58 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  35.25 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  33.61 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 522 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 507 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 508 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  31.35 
 
 		 518 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.21 
 
 		 505 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.31 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.02 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  30.08 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  30.83 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>