More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0112 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  98.96 
 
 		 384 aa  789    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  100 
 
 		 384 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  73.42 
 
 		 382 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  59.09 
 
 		 376 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  61.08 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  49.61 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  51.44 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.59 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.55 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.16 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.29 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.28 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  49.61 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  50.13 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  48.82 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.17 
 
 		 403 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.84 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.88 
 
 		 397 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.05 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.42 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.42 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.42 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.42 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.68 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.63 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47 
 
 		 401 aa  342  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.74 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.44 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.21 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.97 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  46.51 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.14 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  48.04 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.45 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.74 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.33 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  45.29 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  46.93 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.34 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 		 388 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.29 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  45.53 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45.79 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.41 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45.79 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  45.09 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.97 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.16 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  47.77 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  42.28 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  44.76 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  44.44 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.91 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  44.82 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  44.15 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  45.33 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  43.88 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  44.65 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  43.88 
 
 		 395 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  43.88 
 
 		 395 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  43.85 
 
 		 391 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  46.39 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.21 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.39 
 
 		 388 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  45.87 
 
 		 381 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.36 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.21 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  43.31 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  44.27 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  43.62 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  44.3 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  45.03 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.41 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  42.82 
 
 		 388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  42.63 
 
 		 406 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  43.34 
 
 		 393 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  46.39 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  41.73 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  46.11 
 
 		 386 aa  319  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  42.86 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  43.04 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  43.04 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  43.04 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44.74 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  43.04 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  43.04 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  43.04 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  43.04 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  43.12 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.09 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.95 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.21 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  46.25 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  44.42 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>