156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1292 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  42.27 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  22.11 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.65 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  28.21 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  24.15 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  21.36 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  21.36 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  21.36 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  27.37 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  25.11 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  24.14 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  24.14 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  25.74 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  26.67 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 407 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.77 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  26.52 
 
 		 420 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 407 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  22.73 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  26.01 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  23.6 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.38 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  26.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.14 
 
 		 500 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  24.74 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.58 
 
 		 407 aa  49.3  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.42 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  26.4 
 
 		 878 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.99 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.56 
 
 		 575 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  23.79 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25.89 
 
 		 878 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  25.91 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1096  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.4 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  24.55 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  24.51 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.64 
 
 		 402 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.64 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  23.85 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.58 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  26.55 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  25.73 
 
 		 571 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.41 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 395 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 575 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.58 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 399 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.58 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.58 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  26.52 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>