More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3953 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 579 aa  1164    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  50.64 
 
 		 562 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  46.88 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 		 587 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.34 
 
 		 599 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 		 614 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 		 585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.37 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 599 aa  351  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 		 584 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 		 614 aa  339  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  40.93 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  38.89 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 		 682 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  38.52 
 
 		 584 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.91 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 593 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  39.85 
 
 		 584 aa  330  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  37.66 
 
 		 630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 593 aa  326  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  38.59 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  36.02 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 607 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  40.65 
 
 		 696 aa  317  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 		 582 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.92 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 		 597 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  36.48 
 
 		 583 aa  307  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 		 646 aa  289  9e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  32.97 
 
 		 572 aa  283  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 675 aa  240  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 586 aa  233  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 644 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 553 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.82 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.55 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 		 670 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.35 
 
 		 622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.53 
 
 		 656 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 578 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.11 
 
 		 580 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31 
 
 		 657 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 654 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.08 
 
 		 703 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.21 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.21 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 583 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.31 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.99 
 
 		 575 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 654 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  29.96 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  32.06 
 
 		 575 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.66 
 
 		 609 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 710 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  27.81 
 
 		 585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32 
 
 		 660 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 613 aa  197  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 680 aa  197  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  31.5 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 657 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  31.5 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 614 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 578 aa  193  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 588 aa  193  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  30.4 
 
 		 711 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>