More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3532 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
500 aa  998    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.67 
 
 
513 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.29 
 
 
507 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.49 
 
 
507 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.94 
 
 
526 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  44.87 
 
 
507 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.74 
 
 
527 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.54 
 
 
527 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 
508 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.8 
 
 
516 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.18 
 
 
509 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  41.8 
 
 
514 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.94 
 
 
529 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 
532 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 
511 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.57 
 
 
514 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42 
 
 
511 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 
509 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 
493 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 
512 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.94 
 
 
512 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 
508 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.77 
 
 
534 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.4 
 
 
513 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.51 
 
 
512 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 
513 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 
513 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.78 
 
 
524 aa  329  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 
511 aa  329  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 
520 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 
518 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 
520 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 
517 aa  292  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.26 
 
 
537 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 
515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
515 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 
521 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 
517 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  33.95 
 
 
495 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  33.47 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  33.83 
 
 
526 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.43 
 
 
509 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.43 
 
 
509 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  33.4 
 
 
526 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 
506 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
519 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
530 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 
532 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
514 aa  249  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 
510 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.66 
 
 
503 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 
526 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
511 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 
511 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  33.99 
 
 
561 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 
530 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 
534 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 
534 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 
536 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 
539 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.12 
 
 
539 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.12 
 
 
539 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.12 
 
 
539 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
530 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 
526 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  29.92 
 
 
539 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.92 
 
 
539 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
530 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.92 
 
 
539 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
530 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.04 
 
 
512 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 
520 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 
512 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
554 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 
511 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 
529 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 
529 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 
532 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.63 
 
 
529 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  30.61 
 
 
512 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 
511 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
529 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 
511 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  30.82 
 
 
512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  30.82 
 
 
512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 
511 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  30.61 
 
 
512 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 
521 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  31.02 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  31.02 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>