More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1234 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  38.42 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  37.24 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  37.57 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  32.98 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  34.2 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 		 658 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  36.64 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  31.91 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.18 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  28.47 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  34.86 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  39.6 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.78 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.57 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  30.19 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.78 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  33.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  34 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  25.13 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.66 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  41.1 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  28.75 
 
 		 623 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  47.95 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  33.33 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 586 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  31.43 
 
 		 464 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.87 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.01 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.25 
 
 		 505 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  32.38 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  37.37 
 
 		 658 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.08 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  29.52 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.1 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.18 
 
 		 890 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>