More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0726 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  320  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  56.76 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  54.66 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  54.05 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  56.94 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  56.94 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  44 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  44 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  44 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  43.33 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 192 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  42.04 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  50.68 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  38.67 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  29.56 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  36.08 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.9 
 
 		 169 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  32.89 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.14 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>