152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  100 
 
 		 402 aa  807    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  72.81 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  48.91 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  51.29 
 
 		 355 aa  269  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  45.75 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  53.77 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  47.01 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  49.22 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  49.22 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  49.22 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  48.54 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  43.95 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  48.75 
 
 		 298 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  51.97 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  40.73 
 
 		 360 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  40.66 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  34.77 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  36.42 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 300 aa  156  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  35.86 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  36.43 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  33.9 
 
 		 324 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  35.38 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.71 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  27.62 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  24.05 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.2 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.8 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  25.25 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.6 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  24.65 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.9 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.43 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  22.59 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.75 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  24.53 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  23.86 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  24.53 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  26.82 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.44 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  26.26 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  23.43 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.78 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.32 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  22.96 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.11 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.17 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.74 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  23.59 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  21.54 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.74 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.84 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  39.08 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.03 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.15 
 
 		 288 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.15 
 
 		 288 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  22.66 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  24.24 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  24.24 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.66 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.39 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.04 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  20.21 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  22.04 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.47 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>