52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  52.5 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  51.06 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  37.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  40.16 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.13 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.48 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  29.93 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  35.61 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  31.21 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  32.67 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  34.13 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  30.6 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.94 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  30.6 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  40.65 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  39.84 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  37.21 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  30.18 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  30.64 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  32.21 
 
 		 347 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  40.34 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  27.4 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  36.75 
 
 		 946 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  37 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  35.35 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  30.47 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  29.77 
 
 		 321 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  30.87 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  37.18 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  32.31 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  36.36 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  36.36 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  36.36 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  27.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  28.47 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  30.37 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  27.78 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  32.82 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  30.77 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  32.18 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  32.05 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  30.77 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  30.77 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  30.77 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  28.57 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  36.9 
 
 		 266 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  27.81 
 
 		 309 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>