More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
341 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  82.45 
 
 
348 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  74.49 
 
 
340 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  76.25 
 
 
335 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
309 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.83 
 
 
346 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
351 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 
321 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
306 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
306 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 
262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
290 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
283 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
335 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
291 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 
282 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
324 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
278 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  34.47 
 
 
320 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  36.04 
 
 
312 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  34.15 
 
 
319 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
291 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
297 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
311 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
291 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
298 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.05 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.03 
 
 
317 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
302 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
287 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
296 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
309 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.23 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.23 
 
 
289 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
304 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  32.53 
 
 
304 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  32.53 
 
 
304 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
294 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  32.53 
 
 
304 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
287 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
288 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
286 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
292 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
291 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
294 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
294 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 
295 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
288 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
292 aa  95.9  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
300 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
291 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
301 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
288 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
290 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
278 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.02 
 
 
494 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
292 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
288 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>