More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 411 aa  786    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  36.75 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 416 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  30.54 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 425 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  34.5 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 416 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  34.5 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  34.23 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  34.23 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  34.23 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  34.23 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.13 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 467 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 415 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  36.02 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  38.4 
 
 		 289 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.88 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.54 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.61 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.07 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.35 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.35 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.27 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.81 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.68 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.79 
 
 		 426 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 444 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.72 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.18 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.94 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.29 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.81 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.56 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.94 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.05 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  27.67 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.94 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.94 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>