125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1723 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1723  Phage integrase  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  24.26 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  25.81 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  25.64 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  25.64 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  25.63 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  26.2 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  24.26 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  25.67 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.84 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  25.95 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 803 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  24.07 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  27.74 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.03 
 
 		 376 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.03 
 
 		 376 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  21.39 
 
 		 319 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  24.56 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  24.56 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  24.36 
 
 		 322 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  23.74 
 
 		 328 aa  48.1  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  26.34 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  23.12 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 326 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  25.32 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  24.55 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  23.12 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  25.64 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.51 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1288  integrase family protein  45.1 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00250501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2246  integrase family protein  45.1 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.94 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 326 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  34.92 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 806 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  26.26 
 
 		 291 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  23.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  23.24 
 
 		 308 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 296 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  25.39 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  23.42 
 
 		 311 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.92 
 
 		 290 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.4 
 
 		 302 aa  44.7  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  21.76 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 298 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  23.35 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  33.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  26.75 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.08 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  25 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  21.21 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  21.31 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  37.7 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0604  integrase family protein  41.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.11 
 
 		 308 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  27.11 
 
 		 468 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  39.22 
 
 		 374 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0216  tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  20.69 
 
 		 295 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  27.22 
 
 		 426 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  23.83 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  23.03 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  24.18 
 
 		 328 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  24.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  23.73 
 
 		 335 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  31.94 
 
 		 335 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  28.42 
 
 		 327 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>