241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1573 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  100 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  96.4 
 
 		 222 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  54.07 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  52.61 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  52.13 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  53.85 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  52.34 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  53.08 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  50.24 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  52.38 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  56.19 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  49.27 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  48.78 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  48.08 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  54.07 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  52.63 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  52.86 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  51.67 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  51.67 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  44.93 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  50.47 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  52.63 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  48.31 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  50.47 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  45.79 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  53.08 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  46.38 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  45.67 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  53.77 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  53.27 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  47.34 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  46.67 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  45.89 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  46.19 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  45.5 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  47.87 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  45.22 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  45.63 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  44.35 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  49.06 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  40.12 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  47.37 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  47.83 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  48.11 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  46.09 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  45.22 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  32.1 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.32 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.46 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  43.24 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.22 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  39.6 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.33 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.33 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.83 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.03 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  31.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  29.32 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  37.2 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.54 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.02 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 		 299 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  42.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  27.21 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 		 312 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.47 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.42 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.72 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  52 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  46 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  43.55 
 
 		 552 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 		 578 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  46 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  37.36 
 
 		 394 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  33.33 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.77 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 		 316 aa  48.5  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.26 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  36.49 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 300 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  28.77 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36.49 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>