285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1106 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 512 aa  998    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  95.12 
 
 		 512 aa  905    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  56.9 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  59.45 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  56.41 
 
 		 530 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  59.92 
 
 		 514 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  57.87 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  58.7 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  60.53 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  62.78 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  54.3 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  57 
 
 		 537 aa  521  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  59.84 
 
 		 526 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  58.46 
 
 		 514 aa  511  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  55.6 
 
 		 533 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  57 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  53.3 
 
 		 544 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 		 503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  58.33 
 
 		 514 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  49.79 
 
 		 520 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  48.41 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  44.62 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  49.29 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.27 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  46.12 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.65 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  46.88 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 		 513 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  45.96 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  45.96 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  45.96 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  46.88 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  45.73 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  45.99 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  47.06 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  45.85 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.83 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  45.65 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  46.45 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  47.07 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  45.91 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  42.13 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  43.29 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  45.91 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  44.36 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  46.96 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  46.45 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  49.3 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  47.73 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  47.31 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.01 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 508 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  46.64 
 
 		 507 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  45.56 
 
 		 511 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  42.27 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  44.82 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 		 505 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  45.25 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  43.03 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  42.63 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 		 510 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  46.04 
 
 		 507 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  45.69 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  45.69 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  45.69 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  44.62 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 		 511 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  44.62 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  44.42 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 497 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 		 506 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 518 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>