161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1233 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1233  Recombinase  100 
 
 
469 aa  946    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 
494 aa  93.6  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.61 
 
 
542 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.44 
 
 
498 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.8 
 
 
542 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.8 
 
 
554 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.72 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.53 
 
 
506 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 
548 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.65 
 
 
613 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.75 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.01 
 
 
521 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.07 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.89 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.86 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.73 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.69 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.33 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.98 
 
 
546 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  23.2 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.13 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 
586 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.72 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.48 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.71 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.92 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  22.94 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.79 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  20.63 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.37 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.8 
 
 
500 aa  67  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.92 
 
 
534 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  24.88 
 
 
563 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.75 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  23.08 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.44 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.04 
 
 
528 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.04 
 
 
528 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  20.63 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  24.46 
 
 
550 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  22.44 
 
 
549 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.97 
 
 
489 aa  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  22.78 
 
 
518 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  22.81 
 
 
537 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.12 
 
 
496 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  22.65 
 
 
525 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.24 
 
 
526 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.44 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  23.01 
 
 
534 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  24.91 
 
 
513 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  23.44 
 
 
534 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  22.43 
 
 
491 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.43 
 
 
522 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  26.57 
 
 
524 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.51 
 
 
550 aa  61.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.25 
 
 
462 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 
523 aa  60.1  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.88 
 
 
665 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  23.12 
 
 
534 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.93 
 
 
529 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  22.06 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  23.38 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  22.92 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.13 
 
 
485 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.44 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.88 
 
 
449 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.88 
 
 
449 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  21.05 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  21.17 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  26.13 
 
 
543 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  21.66 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  23.02 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 
510 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  22.5 
 
 
537 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.38 
 
 
523 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  23.28 
 
 
479 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  23.28 
 
 
479 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.62 
 
 
561 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.26 
 
 
525 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  21.34 
 
 
445 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 
415 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  22.78 
 
 
532 aa  57  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.73 
 
 
522 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  22.57 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.67 
 
 
523 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.1 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.41 
 
 
523 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  23.73 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.41 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 
537 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
522 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  33.33 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.33 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  25.24 
 
 
565 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.78 
 
 
534 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  21.34 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  21.22 
 
 
511 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>