More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0760 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  36.76 
 
 		 229 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  36.27 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  36.27 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  36.27 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  35.78 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  35.78 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  35.32 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  34.33 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  30.23 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  34.31 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  31.28 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  34.31 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  34.31 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  34.31 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  32.35 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  32.71 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  29.23 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  31.84 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  33.83 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  31.28 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  29.63 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  29.41 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  32.78 
 
 		 178 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  34.12 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  34.12 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  34.12 
 
 		 166 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  28.16 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  56.92 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  32.14 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  28.57 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  37.19 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  28.35 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  26.15 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  28.5 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  26.67 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  26.94 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  27.11 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  28.89 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  29.67 
 
 		 366 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.24 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  32.28 
 
 		 360 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2123  peptide chain release factor 1  34.78 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000913582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  27.98 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  32.49 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  48.78 
 
 		 371 aa  78.2  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  27.47 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  40.91 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  26.67 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  39.68 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  33.58 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  41.9 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  28.57 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  35.81 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  32.63 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  30.99 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2212  peptide chain release factor 1  34.78 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.189214  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  30.21 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  39.68 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  27.46 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  29.31 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  26.94 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1645  peptide chain release factor 2  29.35 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  38.84 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  27.06 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  53.97 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  29.33 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  37.19 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  26.6 
 
 		 406 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  53.97 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  25.39 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  30.99 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  41.57 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.59 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  51.35 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  29.23 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  27.23 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  42.35 
 
 		 357 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  28.12 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  43.18 
 
 		 363 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  35 
 
 		 358 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  28.19 
 
 		 361 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  39.5 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  49.33 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  46.43 
 
 		 368 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  28.5 
 
 		 362 aa  74.7  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  39.58 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  25.39 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  34.53 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  35.38 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  37.61 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  25.39 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  25.45 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  33.04 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  36.84 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  33.12 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0721  peptide chain release factor 1  33.66 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>