More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7272 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  43.35 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  35.27 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  36.19 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  35.27 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  35.71 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  35.71 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  35.71 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  34.78 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  34.78 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  34.78 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  34.3 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  36.14 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  34.26 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  34.65 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  32.06 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  35.75 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  35.15 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  31.28 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  34.5 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  35.15 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  37.28 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  33.17 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  36.53 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  36.53 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  36.78 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  31.5 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  37.97 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  34.07 
 
 		 292 aa  94.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  30.58 
 
 		 330 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  34.36 
 
 		 367 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  34.24 
 
 		 367 aa  93.2  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  34.07 
 
 		 304 aa  91.3  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  33.7 
 
 		 356 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  31.28 
 
 		 369 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  31.75 
 
 		 313 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  31.02 
 
 		 386 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  31.75 
 
 		 313 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  34.24 
 
 		 361 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  32.8 
 
 		 354 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 354 aa  89  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  32.8 
 
 		 354 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 365 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  28.64 
 
 		 375 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  33.71 
 
 		 369 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  32.8 
 
 		 354 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  31.67 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  31.52 
 
 		 357 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  35.11 
 
 		 406 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 360 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  30.1 
 
 		 368 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  33.72 
 
 		 330 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  28.42 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  30.98 
 
 		 356 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  29.41 
 
 		 367 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  28.49 
 
 		 365 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 367 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  28.92 
 
 		 366 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  29.38 
 
 		 329 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  32.24 
 
 		 323 aa  85.5  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  28.88 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  30.89 
 
 		 356 aa  85.1  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 325 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  30.21 
 
 		 332 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  30.85 
 
 		 349 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  30.17 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0811  peptide chain release factor 2  30.65 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  30.21 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  30.3 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  30.9 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  29.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  28.42 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  36.53 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  27.45 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  29.53 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  29.89 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  30.9 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  41.51 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  28.09 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  28.11 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  28.65 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  30.05 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  30.16 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  28.65 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1476  peptide chain release factor 2  31.38 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0780074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  29.35 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  28.42 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  28.72 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  29.95 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  30.73 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  30 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  28.49 
 
 		 365 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004438  peptide chain release factor 2  30.11 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  30.21 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  28.34 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  28.49 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  40.91 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  27.89 
 
 		 391 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  30.43 
 
 		 337 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>